从碑文的记载看，佛顶骨真身舍利存在应该确凿无疑，肖贵田表示：“宋代的碑文就是最好的证据。”但此次出土的舍利众多，在金瓶内多达几十粒，而石函内的舍利更是无法计数，究竟哪块才是佛顶骨真身舍利？肖贵田表示，这需要进一步考证，用各种科技手段鉴定之后才有结果。
这是兖州市博物馆展出的石函，其四周和顶盖雕刻有精美的人物图案和花纹
但也有专家指出，佛顶骨真身舍利埋入兴隆塔地宫，没有任何史料记载，而且宋代全国范围内寺庙众多，建塔就是为了供奉舍利，佛骨舍利更是众多寺院梦寐以求的圣物，它的存在直接关乎寺院的香火和等级，因此佛顶骨真身舍利是否真的埋在兴隆塔地宫，还是一个值得考证的问题。
