据《清稗类钞》宦官类记载和李家的后人回忆：李莲英并不是死于非命，而是得病而死。记载中称：孝钦殂后，不意又为隆裕后所庇……殆其病卒，隆裕后特赏银两千两”。李莲英的墓志铭中也说李莲英“退居之时，年已衰老，公殒于宣统三年二月初四日”。但李莲英到底是不是善终的呢?
李莲英墓在北京恩济庄太监墓地，李莲英在建坟时耗资巨大，据说建造坟墓时使用了大量的鸡蛋，用蛋白拌石灰，江米粥灌浆，修筑坟茔。有人曾对李莲英的“鸡蛋坟”吟诗一首：“马鬣封头鸡卵坟，黎民血泪染石灰。可叹莲公达显宦，焉与三宝共争辉?”
1966年的时候，人们曾经打开过李莲英的坟墓，人们确实在他的坟墓中发现了大量的珍宝，如象乒乓球一样大小的宝珠，金子做的烟碟以及数不清的珍珠、翡翠、玛瑙等宝物。不过令人吃惊的是，他的棺材里除一颗头颅和一条长辫子外，没有尸身。从墓里的情况来看，李莲英似乎真的是被人杀了个身首异处而死的。不过也有人说，有些太监的墓里面都是只有一个头，这是因为那个时代的人都很迷信，以为自己的残缺之身，是有辱祖宗容颜的事情。死后也没脸去见自己的列祖列宗，于是死后只藏自己的头颅，而将身体舍弃。李莲英死后是不是也是这种情况呢?这也不好说。
